В 1937 г. назначается на должность заведующего кафедры Древней истории и археологии Харьковского государственного университета. Тогда же он получает звание профессора. В 1942—1943 гг. был заведующим кафедры Общей истории Объединённого украинского университета в Кзыл-Орде (теперь г. Кызылорда, Казахстан). В 1948 г. стал доктором исторических наук.
Семенов-Зусер С. А. Князь Святослав. — Харків: Харківське книжково-газетне видавництво, 1946. — 58 с.
Семенов-Зусер С. А. Опыт историографии скифов. Ч. 1. Скифская проблема в отечественной науке. 1692—1947. — Харьков, 1947. — 192 с.
Семенов-Зусер С. А. Родовая организация у скифов Геродота. — Л.: Огиз., 1931. — 34 с.
Семенов-Зусер С. А. Рыбное хозяйство и рынки на юге СССР в древности. — Харьков: Харьковский государственный университет, 1947. — 46 с.
Семенов-Зусер С. А. Стародавня історія. — К.: Радянська школа, 1949. — Вип. 1. — 163 с.
Семенов-Зусер С. А. Таврские мегалиты (Из материалов Крымской археологической экспедиции Академии наук СССР). — 1940 . — 161 с.
Семенов-Зусер С. А. Физическая культура и зрелища в древнегреческих колониях Северного Причерноморья. — Харьков, 1940.
Статьи
Семенов-Зусер С. А. Дольмены в Крыму. К вопросу о циклопических памятниках в СССР // Вестник знания. — 1931. — № 15-16. — С. 809—812.
Семенов-Зусер С. А. Дослідження Салтівського могильника // Археологічні пам’ятки УРСР. — 1952. — Т. 3.
Семенов-Зусер С. А. К вопросу о мегалитических памятниках в Крыму // Природа. — 1931. — № 5. — С. 479—506.
Семёнов-Зусер С. А. Краснокутские курганы // Учёные записки Харьковского государственного университета за 1939 г. — Харьков, 1939. — № 15. — С. 63—88.
Семенов-Зусер С. А. Ранні слов’яни і Київська Русь: Матеріали польових досліджень Інституту археології АН УРСР за 1947—1948. — К., 1952.
Семенов-Зусер С. А. Родовая организация у скифов Геродота // Известия Государственной академии истории материальной культуры. — 1931. — Т. IX. Вып. 1.
Семенов-Зусер С. А. Розкопки близь с. Верхнього Салтова в 1946 р. // Археологічні пам’ятки УРСР. — 1949. — Т. 1.
Семенов-Зусер С. А. Рыбный рынок в Херсонесе // Вестник древней истории. — 1947. — № 2. — С. 237—246.
Семенов-Зусер С. А. Скіфи-кочовики на території Північного Причорномор’я // Наукові записки Харківського педагогічного інституту. — 1939. — Т. 1. — С. 155—217.
Семенов-Зусер С. А. Торговый путь к Ольвии. (Западное побережье Чёрного моря) // Ученые записки Харьковского университета. — 1940. — Т. 19. — 1940. — С. 79—103.
Литература
Парфиненко А. Ю., Посохов С. И. Страницы истории студенческой науки в Харьковском университете. — Харьков: МД, 2002. — 116 с.
Семенов-Зусер Семен Анатолійович // Радянська енциклопедія історії України. — К.: Українська радянська енциклопедія, 1972. — Т. 4. — С. 82.
Українські історики XX століття: Біобібліографічний довідник. Серія «Українські історики». — К.: Інститут історії України НАН України, 2006. — Вип. 2, ч. 3. — 315 с.
Шрамко Б. А. Памяти профессора С. А. Семенова-Зусера // Краткие сообщения Института археологии АН УССР. — К.: Академия наук УССР, 1952. — Вып. 1. — С. 108—109.
Ясь О. В. Семенов-Зусер Семен Анатолійович // Енциклопедія історії України. — К.: Наукова думка, 2012. — Т. 9. — С. 523.