Комплекс сращивания экзонов

06-06-2023

Структура кора комплекса соединения экзонов, связанного с РНК. Разрешение 2,3 ангстрема

Ко́мплекс сра́щивания экзо́нов[1] (англ. Exon junction complex, EJC) — белковый комплекс, формирующийся на пре-мРНК в месте соединения двух экзонов, которые оказались соединёнными друг с другом в ходе сплайсинга. EJC оказывает значительное влияние на контроль качества трансляцию и локализацию сплайсированной мРНК[2]. Считается, что комплекс соединения экзонов обеспечивает позиционно-специфичную память о произошедшем акте сплайсинга. EJC состоит из стабильного гетеротетрамерного кора, который служит платформой для связывания других факторов, вовлечённых в посттранскрипционную регуляцию мРНК[2]. Кор EJC состоит содержит эукариотический фактор инициации трансляции eIF4A-III[en] (РНК-хеликаза, содержащая мотив DEAD-бокс[en]), связывающийся с аналогом АТФ, а также дополнительные белки Magoh[en] и Y14[en][3]. Кроме того, EJC взаимодействует со многими другими белками, например, SR-белками[en][4]. Предполагается, что эти взаимодействия играют важную роль в компактизации мРНК[4].

Состав

В состав EJC входит несколько ключевых белков: RNPS1[en], Y14, SRm160[en], Aly/REF[en], Magoh и другие[5][6][7]. RNPS1 может функционировать как коактиватор сплайсинга, а также вместе с Y14 принимает участие в нонсенс-опосредованном распаде (NMD)[8][9]. Предполагается, что SRm160 ускоряет процессинг 3'-конца мРНК[10][11]. Magoh, вероятно, облегчает транспорт мРНК в цитоплазму, а Aly участвует с процессе ядерного экспорта мРНК[12][13][14]. Aly привлекается в комплекс EJC белком UAP56[en][15], который функционирует как фактор сплайсинга, необходимый для сборки сплайсосомы[16]. Белок DEK также входит в состав EJC, однако он принимает участие и во многих других процессах: от сплайсинга до регуляции транскрипции и структуры хроматина[17][18][19].

Структура

Кор комплекса EJC собирается вокруг фактора трансляции eIF4AIII. В связанном с мРНК виде он существует в двух конформациях: открытой и закрытой. В закрытом состоянии два домена этого белка образуют два сайта связывания: для мРНК и для 5'-аденилил-β-имидодифосфата (ADPNP)[20]. В открытой конформации два домена повернуты на 160° относительно своего положения в закрытой конформации. Белки Magoh и Y14 связываются друг с другом, образуя гетеродимер, расположенный на полюсе EJC, обращённом к 5'-концу мРНК[21][22][23]. Magoh связывается с eIF4AIII при помощи аминокислотных остатков, формирующих две С-концевые α-спирали, а также один конец большого β-листа[20]. Консервативные остатки в линкере, соединяющем два домена eIF4AIII, формируют соляные мостики[en] или водородные связи с остатками в Magoh[20]. Y14 и eIF4AIII связаны посредством единственной связи — соляного мостика между остатками Arg108 Y14 и Asp401 eIF4AIII[20]. Если в этих остатках происходит мутация, то Magoh-Y14 не может связываться с eIF4AIII[24].

Функционирование

Принципиальная схема нонсенс-опосредованного распада

В ходе сплайсинга в клетках эукариот EJC связывается с мРНК примерно на 20—24 нуклеотида выше соединения экзонов[25][26]. Связывание EJC с мРНК не зависит от нуклеотидной последовательности последней[7]. EJC остаётся связанным с мРНК при её экспорте из ядра в цитоплазму. Чтобы мРНК могла пройти через ядерную пору, с ней должны связаться два димера: NXF1[en]/TAP и NXT1[en]/p15[en][27]. NXF1/TAP является ключевым рецептором экспорта мРНК в цитоплазму, поскольку он взаимодействует со связанными с РНК адаптерными белками и с компонентами ядерного порового комплекса[28].

Ключевая роль EJC — участие в контроле качества мРНК, а именно в процессе нонсенс-опосредованного распада (NMD), приводящего к разрушению мРНК, содержащих преждевременные стоп-кодоны. При трансляции нормальной мРНК рибосома связывается с транскриптом и начинает синтезировать цепочку аминокислот. Когда она доходит до комплекса соединения экзонов, она вытесняет его и продолжает трансляцию до достижения стоп-кодона. Если же мРНК содержит преждевременный стоп-кодон, расположенный по ходу рибосомы до EJC, EJC останется связанным с транскриптом и запустит его разрушение[29].

EJC задействованы в NMD и другим образом: они привлекают к транскрипту факторы контроля качества UPF1[en], UPF2[en] и UPF3[en][30]. Эти белки играют ключевую роль в NMD. Белки Magoh, Y14 и eIF4AIII, входящие в состав EJC, обеспечивают связывание комплекса с UPF3. UPF3 выступает в роли «мостика» между белками UPF2 и UPF1, обеспечивая формирование тримера[31]. В этом тримере UPF2 и UPF3 действуют кооперативно, стимулируя АТФазную и РНК-хеликазную активность UPF1. Кор EJC прочно связывает комплекс UPF с мРНК и принимает участие в регуляции активности белка UPF1. Рибосомы, остановившиеся на преждевременном стоп-кодоне, привлекают UPF1 через взаимодействие с факторами терминации трансляции eRF1[en] и eRF3[en]. Вместе с белком SMG1[en] eRF1, eRF3 и UPF1 формируют комплекс, известный как SURF. Он формирует «мостик» между рибосомой и нижележащим EJC, связанным с белками UPF2 и UPF3. Это взаимодействие запускает фосфорилирование UPF1 белком SMG1, которое приводит к диссоциации eRF1 и eRF3. Оставшийся комплекс белков EJC, UPF3, UPF2, фосфорилированного UPF1 и SMG1 запускает разрушение мРНК[31].

Примечания

  1. Кребс Дж., Голдштейн Э., Килпатрик С. Гены по Льюину. — М.: Лаборатория знаний, 2017. — С. 616. — 919 с. — ISBN 978-5-906828-24-8.
  2. ↑ исправить]
  3. исправить]
  4. ↑ исправить]
  5. исправить]
  6. исправить]
  7. ↑ исправить]
  8. исправить]
  9. исправить]
  10. исправить]
  11. исправить]
  12. исправить]
  13. исправить]
  14. исправить]
  15. исправить]
  16. исправить]
  17. исправить]
  18. исправить]
  19. исправить]
  20. ↑ исправить]
  21. исправить]
  22. исправить]
  23. исправить]
  24. исправить]
  25. исправить]
  26. исправить]
  27. исправить]
  28. исправить]
  29. исправить]
  30. исправить]
  31. ↑ исправить]

Комплекс сращивания экзонов.

© 2011–2023 stamp-i-k.ru, Россия, Барнаул, ул. Анатолия 32, +7 (3852) 15-49-47